同安区工商行政管理局隶属厦门市工商行政管理局，机关设有九个科室，分别是办公室、政工科、法制科、注册登记管理科、外资科、市场合同监督管理科、商标广告监督管理科、公平交易科、12315消费者申诉举报服务台（消费者权益保护科）；下设四个工商所，分别是大同工商所、城西工商所、祥桥工商所、祥平工商所；并设福建省工商行政管理局同安区经济检查大队。区局现有在编干部职工95人。

近年来，同安区工商行政管理局坚持以科学发展观为统领，围绕市局党组的中心工作，积极落实监管与发展、服务、维权、执法的“四个统一”，突出服务发展、服务民生、服务和谐，大力倡导“人性化监管，零距离服务”理念，弘扬奉献、拚搏、创新、敬业、律己的工商“五种精神”，开拓创新、扎实工作，为维护辖区公平竞争的市场秩序，保护消费者合法权益，促进同安经济又好又快发展，构建和谐社会做出了积极贡献。